肛门湿疹病因比较复杂，一般认为与过敏反应有关。如吃了对自身过敏的食物、药物，如鱼虾、蟹、磺胺类药、某些抗生素等，或接触某些致敏的物品，如生漆、花粉、毛织品、化学品或外用药物、染料、湿热、寒冷等均可诱发致病。另外，内分泌失调，消化功能紊乱，肠道寄生虫病等疾病及痔疮、肛瘘、肛裂、肛管上皮缺损等肛门局部疾病的慢性刺激，也可以诱发湿疹。

中医把肛门湿疹引起的原因归结为“风湿热客于肌肤而成”，急性者以湿热为主，慢性多伴有血虚生风，以致风燥郁结，肌肤失养而发。

治疗本病先要找出引起过敏的原因，避免再食、用和接触这些食品、物品。得病后要避免局部刺激，如搔抓、摩擦、洗烫、滥用药物熏洗或外敷。要禁忌饮食辣椒、芥末、葱蒜、白酒等富刺激性食物，以免加重病情，还要防止腹泻和便秘及其它诱发原因。

药物治疗：西医最常用脱敏疗法，抗过敏药物具有镇静止痒效能。中医药治疗湿疹有良好效果。